Aa hayret, çok güzel bi soru, tonla cevap gelir diye düşünmüştüm ama henüz kimse cevap yazmamış.
Tam kategorize etmeyecem, web, scene vb. gibi ama ben windows üzerinde aşağıdaki araçları kullanıyorum:
Text editör olarak EditPlus, çok hızlı ve kullanışlı. Benzer şekilde, Notepad++, UltraEdit, Programmers Notepad, Crimson Editor, ConText gibi güzel text editörler de çok insan tarafından kullanılıyordur eminim.
Hexplorer windowsta gördüğüm en güzel (ve free) hex editörü. XVI32 de free ve güzel bir hex editör.
Diagram ve benzeri çizim işlemleri için: Rise Editor (Bloom), Dia, Freemind, Creative Docs.Net, yED
Grafik işleri için: XnViewer, Paint.Net, ProMotion 4.7, GIMP
Ek olarak; Qdir, Cinta Notes, Deskpin ve olmazsa olmaz Everything (bu muhteşem bi tool işte)
Development için çoğunlukla Editplus, ondan başka Visual Studio, Codeblocks C/C++ IDE
SQL için SqlDbAid (süper bi tool), SQLYog (mysql için), phpmyadmin, Toad for SQL (MS sql 2005/2008), ve EMS'nin free sql toollar (postgre, mysql, mssql)
Bunlar dışında da kendi yazdığım ve benim ihtiyaçlarımı karşılayan onlarca tool var.